В отличие от чиллера, работающего на воздушном охлаждении, водяной аналог имеет меньшие габариты, так как вода имеет большую теплоемкость, чем воздух. Независимость агрегата от воздушного притока наряду с его небольшими размерами позволяет размещать его внутри здания, в небольшом техническом помещении.
Установка такого оборудования особенно выгодна, когда есть потребитель горячей воды. Однако чиллер с водяным охлаждением имеет также недостаток. Чтобы не засорялся конденсатор, необходимо использовать фильтр и проточную воду. При использовании рециркуляционной воды потребуется устанавливать драйкуллер или градирню.